식물표본을 만들기 위해서는 식물을 채취해야 하므로 자칫 생태계를 훼손할 위험이 있기 때문에 유의해야 할 점들이 있다. 채집에 앞서 먼저 생각해야 할 것은 채집된 식물은 모두 표본으로 만들어져 영구보관되어야 한다는 것이다. 또 만들어진 표본은 관련 학문을 연구하는 사람들에게 제공해 이용되어져야 한다는 것이다. 이런 문제를 해결할 수 없기 때문에 국민학생들의 여름방학 과제의 단골메뉴였던 식물채집이나 곤충채집이 사라지기도 했다. 그리고 법적으로 식물채집이 금지돼 있는 지역이 있는데 내무부 또는 지방자치단체가 관리하는 국립공원, 도립공원, 군립공원과 환경부가 지정한 자연생태계보존지역, 문화체육부의 천연기념물지정 지역 등이 그런 곳이다. 또 환경부가 특정야생식물로 지정한 춘란, 금강초롱꽃, 삼지구엽초, 구름송이풀 등 126종의 식물은 허가 없이 채집하거나 집에서 기르면 위법행위가 된다. 채집이 금지된 지역에서도 관리당국의 허가를 받으면 채집이 가능하지만 학자나 학술단체가 아닌 경우에는 허가하지 않는 것이 보통이다.식물표본 만들기는 채집, 압착건조, 표본붙이기, 이름표붙이기 등의 순서로 진행된다. 표본을 만들기 위해 식물을 채집할 때는 생식기관이 달린 것을 채집해야 한다. 식물의 특징을 가장 잘 보여주는 것이 꽃이나 열매 등 생식기관이기 때문이다. 채집에 필요한 기구는 폭이 좁은 모종삽과 전정가위, 채집봉투 등이다. 손으로 파거나 꺾으면 제대로 채취할 수 없기 때문에 모종삽과 전정가위는 필수장비다. 채집봉투는 지도 패킹용 비닐처럼 약간 두껍고 투명한 것으로 만들면 되는데 폭 30센티미터, 깊이 60센티미터 정도가 적당하다.초본을 채집할 때는 모종삽을 뿌리 주위에 찔러 넣어 흙과 함께 뿌리째 들어올린 후 흙을 털어낸다. 구덩이는 식물을 채집할 때 나온 흙으로 반드시 메운다. 나무는 꽃이나 열매가 있는 가지를 30센티미터 정도 전정가위로 비스듬하게 자른다(절단면이 최대 면적이 되게). 채집한 식물은 목본과 초본을 다른 봉투에 넣어 초본이 목본에 눌려 손상되는 것을 막는다.채집장소의 고도, 지형, 식생 등을 세밀하게 기록한 쪽지를 채집봉투에 넣어두면 이름표를 작성할 때 큰 도움이 된다. 식물을 넣은 봉투는 위를 접어 건조해지는 것을 막도록 하고 배낭에 차곡차곡 세워서 넣는다. 집으로 돌아오면 채집물을 정리한다. 신문지를 깔고 채집봉투를 열어 하나씩 종류별로 구분해 가지런히 놓는다. 이때 식물도감에서 식물을 찾아보며 식물이름을 익히면 좋다. 식물을 넣어 건조시킬 신문지는 잘 마른 헌 신문지가 새 신문지보다 낫다. 두세 장의 신문을 한번 접어 그 사이에 식물을 넣는다. 이때 잎과 꽃을 잘 펴주는 것이 좋은 표본을 만드는 요령이다. 연약한 꽃 부분은 부드러운 종이로 덮어주면 좋다. 식물이 들어있는 신문 위에 다시 빈 신문을 놓은(접은 면이 반대쪽이 되게) 다음 골판지를 올린다. 그 위에 다시 식물이 들어있는 신문지를 놓고, 위와 같은 방법으로 쌓아나간다. 이 작업이 끝나면 위아래에 나무판(가운데 구멍이 뚫린 것이면 더욱 좋다)을 대고 압착한다. 끈으로 단단히 묶고 위에 벽돌 등으로 눌러준다. 식물이 완전히 마를 때까지 하루 주기로 신문지를 갈아준다.다음은 건조된 표본을 대지에 올리는 과정이다. 대지는 가로 30센티미터, 세로 42센티미터 정도의 규격이면 되는데 이 사이즈를 국제적으로 통용하고 있다. 오래 되었을 때 삭는 것을 막기 위해 외국에서는 산이 들어있지 않은(acid free) 종이를 사용하는데 국내에서는 구하기가 힘들다. 보통 국내에서 생산되는 가장 두꺼운 모조지인 260그램 짜리 모조지를 사용한다.대지에 표본을 올릴 때는 한 식물을 한 대지에 올리는 것을 원칙으로 한다. 식물을 대지에 올려놓은 다음 가늘게 자른 창호지로 몇 군데를 붙인다. 대지를 거꾸로 들었을 때 표본이 덜렁거리지 않을 정도면 된다. 외국에서는 표본의 한쪽면 전체에 풀을 발라 대지에 붙이기도 하는데 도배할 때 쓰는 풀을 희석해 사용한다. 대지에 표본올리기가 끝나면 대지 오른쪽 아래에 이름표를 붙인다. 이름표는 표본의 모든 것을 나타내주는 중요한 기록으로 식물의 학명, 국명, 채집자, 채집지, 동정자 등을 가능한 자세히 써넣는다. 이름표는 표본이 보존되는 한 영구히 붙어 다니는 것으로 관리가 제대로 되는 표본관의 표본들은 하나의 표본에 여러 개의 이름표가 함께 붙어있다. 이는 표본관에 보관된 표본을 다른 학자가 연구목적으로 보았을 때 새로운 이름표를 다시 붙여나가기 때문이다. 새로운 이름표에는 학명, 동정자와 관찰날짜 등이 붙어있다. 이 과정이야말로 표본이 생명력을 얻어 가는 과정이며, 이런 과정이 있기 때문에 표본제작을 위한 채집이 자연보존에 위배되지 않는다는 논리를 세울 수 있는 것이다. 우리나라의 경우 이러한 과정이 제대로 이루어지지 않기 때문에 학자들이라 하더라도 자연을 파괴한다는 비난을 받을 소지가 있다. 특정 산의 식물상을 조사할 때에 이처럼 채집된 식물이 표본으로 만들어져 표본관에 소장이 되고 이 표본이 계속 연구되어 진다면 그 산의 식물상은 정확히 조사될 수 있다. 자연공원법에 의해 10년에 한번씩 식물상을 조사하게 되어 있는 국립공원의 식물조사에 이런 원리를 활용하면 국립공원에서 자라고 있는 정확한 식물목록이 만들어질 수 있을 것이다. 확증표본 없이 식물목록만 제시하는 조사는 몇 번을 하더라도 남는 것이 없이 예산만 낭비하는 결과를 낳는다. 다시 한번 강조하건대 일반인이 식물표본을 만들 때는 영구보존과 이용이라는 측면이 충분히 고려되어야 한다. 개인은 여러 면에서 표본의 제작이나 이를 다른 사람들이 이용케 하는 데는 한계가 있다. 따라서 개인이 식물을 채집해 표본을 만드는 경우에는 표본을, 제대로 운용되고 있는 표본관에 기증하는 식으로 문제를 해결할 수 있다. 이 경우 표본에는 채집자가 명시되어 있어 기증자의 이름이 영구히 보존된다. 우리나라 식물표본관의 역사는 일천하고 또 운영자들의 자질부족으로 수십년 동안 제대로 관리되어 오지 못한 것이 사실이다. 그러나 최근에는 표본관의 역할과 운영방법을 제대로 배운 젊은 학자들이 관리하는 표본관이 늘어나고 있어 희망적인 일이다.